Procedura PHREG
Analiza bayesowska
| Informacje o modelach | |
|---|---|
| Zbiór | WORK.METABRIC_CLEANED |
| Zmienna zależna | t |
| Zmienna cenzurująca | c |
| Wartości cenzurujące | 0 |
| Model | Cox |
| Rangi wiązane | BRESLOW |
| Algorytm próbkowania | ARMS |
| Wielkość wyżarzania | 5000 |
| Wielkość próbki MC | 50000 |
| Przerzedzanie | 5 |
|
Liczba obserwacji wczytanych
Liczba obserwacji użytych
|
854
854
|
|---|
| Informacje o poziomach klasyfikacji | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| Klasa | Wartość | Zmienne projektowe | ||||
| lnep_c | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | |
| 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | ||
| 2 | 0 | 0 | 1 | 0 | ||
| 3 | 0 | 0 | 0 | 1 | ||
| 4 | 0 | 0 | 0 | 0 | ||
| age_c | 1 | 1 | 0 | 0 | ||
| 2 | 0 | 1 | 0 | |||
| 3 | 0 | 0 | 1 | |||
| 4 | 0 | 0 | 0 | |||
| radio_therapy | 0 | 1 | ||||
| 1 | 0 | |||||
| ts_c | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| 2 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | |
| 3 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | |
| 4 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | |
| 5 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | |
| 6 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | |
| her_status | 0 | 1 | ||||
| 1 | 0 | |||||
| Podsumowanie liczby zdarzeń i wartości ocenzurowanych | |||
|---|---|---|---|
| Suma | Wystąpienie | Ocenzurowane | Procent ocenzurowanych |
| 854 | 370 | 484 | 56.67 |
| Informacje o parametrach regresji | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| Parametr | Efekt | lnep_c | age_c | radio_therapy | ts_c | her_status |
| lnep_c0 | lnep_c | 0 | ||||
| lnep_c1 | lnep_c | 1 | ||||
| lnep_c2 | lnep_c | 2 | ||||
| lnep_c3 | lnep_c | 3 | ||||
| age_c1 | age_c | 1 | ||||
| age_c2 | age_c | 2 | ||||
| age_c3 | age_c | 3 | ||||
| radio_therapy0 | radio_therapy | 0 | ||||
| ts_c1 | ts_c | 1 | ||||
| ts_c2 | ts_c | 2 | ||||
| ts_c3 | ts_c | 3 | ||||
| ts_c4 | ts_c | 4 | ||||
| ts_c5 | ts_c | 5 | ||||
| her_status0 | her_status | 0 | ||||
| Oceny największej wiarygodności | |||||
|---|---|---|---|---|---|
| Parametr | DF | Ocena | Błąd standardowy |
Przedział ufności 95% | |
| lnep_c0 | 1 | -1.0287 | 0.3045 | -1.6255 | -0.4318 |
| lnep_c1 | 1 | -0.7467 | 0.3035 | -1.3416 | -0.1518 |
| lnep_c2 | 1 | -0.2893 | 0.3072 | -0.8913 | 0.3128 |
| lnep_c3 | 1 | 0.1706 | 0.3147 | -0.4463 | 0.7875 |
| age_c1 | 1 | -0.7491 | 0.1531 | -1.0491 | -0.4491 |
| age_c2 | 1 | -0.6992 | 0.1451 | -0.9836 | -0.4149 |
| age_c3 | 1 | -0.5708 | 0.1475 | -0.8600 | -0.2817 |
| radio_therapy0 | 1 | -0.4188 | 0.1142 | -0.6426 | -0.1950 |
| ts_c1 | 1 | -2.4443 | 1.0533 | -4.5087 | -0.3800 |
| ts_c2 | 1 | -1.5076 | 1.0465 | -3.5587 | 0.5435 |
| ts_c3 | 1 | -1.2065 | 0.3225 | -1.8386 | -0.5744 |
| ts_c4 | 1 | -0.8475 | 0.3034 | -1.4421 | -0.2529 |
| ts_c5 | 1 | -0.6481 | 0.3454 | -1.3250 | 0.0287 |
| her_status0 | 1 | -0.7174 | 0.1357 | -0.9834 | -0.4514 |
| Niezależne prawdopodobieństwo a priori rozkładu normalnego dla współczynników regresji | ||
|---|---|---|
| Parametr | Średnia | Dokładność |
| lnep_c0 | 0 | 1E-6 |
| lnep_c1 | 0 | 1E-6 |
| lnep_c2 | 0 | 1E-6 |
| lnep_c3 | 0 | 1E-6 |
| age_c1 | 0 | 1E-6 |
| age_c2 | 0 | 1E-6 |
| age_c3 | 0 | 1E-6 |
| radio_therapy0 | 0 | 1E-6 |
| ts_c1 | 0 | 1E-6 |
| ts_c2 | 0 | 1E-6 |
| ts_c3 | 0 | 1E-6 |
| ts_c4 | 0 | 1E-6 |
| ts_c5 | 0 | 1E-6 |
| her_status0 | 0 | 1E-6 |
| Początkowe wartości łańcucha | |||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Łańcuch | Ziarno | lnep_c0 | lnep_c1 | lnep_c2 | lnep_c3 | age_c1 | age_c2 | age_c3 | radio_therapy0 | ts_c1 | ts_c2 | ts_c3 | ts_c4 | ts_c5 | her_status0 |
| 1 | 123 | -1.0287 | -0.7467 | -0.2893 | 0.1706 | -0.7491 | -0.6992 | -0.5708 | -0.4188 | -2.4443 | -1.5076 | -1.2065 | -0.8475 | -0.6481 | -0.7174 |
| Statystyki dopasowania | |
|---|---|
| DIC (im mniejsze tym lepsze) | 4500.029 |
| pD (efektywna liczba parametrów) | 13.618 |
Procedura PHREG
Analiza bayesowska
| Podsumowania i przedziały a posteriori | |||||
|---|---|---|---|---|---|
| Parametr | N | Średnia | Odchylenie standardowe |
Przedział HPD 95% | |
| lnep_c0 | 10000 | -0.9966 | 0.3067 | -1.6028 | -0.3904 |
| lnep_c1 | 10000 | -0.7164 | 0.3040 | -1.3353 | -0.1390 |
| lnep_c2 | 10000 | -0.2634 | 0.3111 | -0.8826 | 0.3426 |
| lnep_c3 | 10000 | 0.1946 | 0.3198 | -0.4203 | 0.8466 |
| age_c1 | 10000 | -0.7514 | 0.1550 | -1.0479 | -0.4451 |
| age_c2 | 10000 | -0.7015 | 0.1468 | -0.9911 | -0.4206 |
| age_c3 | 10000 | -0.5728 | 0.1483 | -0.8702 | -0.2910 |
| radio_therapy0 | 10000 | -0.4170 | 0.1136 | -0.6354 | -0.1958 |
| ts_c1 | 10000 | -2.9517 | 1.2403 | -5.5036 | -0.7563 |
| ts_c2 | 10000 | -2.0308 | 1.2578 | -4.6709 | 0.1720 |
| ts_c3 | 10000 | -1.1805 | 0.3197 | -1.7997 | -0.5518 |
| ts_c4 | 10000 | -0.8160 | 0.3031 | -1.3975 | -0.2231 |
| ts_c5 | 10000 | -0.6288 | 0.3441 | -1.3116 | 0.0483 |
| her_status0 | 10000 | -0.7123 | 0.1352 | -0.9648 | -0.4372 |
Procedura PHREG
Analiza bayesowska
| Efektywne liczebności prób | |||
|---|---|---|---|
| Parametr | ESS | Czas autokorelacji |
Skuteczność |
| lnep_c0 | 2308.3 | 4.3322 | 0.2308 |
| lnep_c1 | 2296.5 | 4.3544 | 0.2297 |
| lnep_c2 | 2389.3 | 4.1853 | 0.2389 |
| lnep_c3 | 2664.4 | 3.7533 | 0.2664 |
| age_c1 | 10000.0 | 1.0000 | 1.0000 |
| age_c2 | 9612.1 | 1.0404 | 0.9612 |
| age_c3 | 9761.9 | 1.0244 | 0.9762 |
| radio_therapy0 | 10001.8 | 0.9998 | 1.0002 |
| ts_c1 | 8841.4 | 1.1310 | 0.8841 |
| ts_c2 | 9520.9 | 1.0503 | 0.9521 |
| ts_c3 | 3079.5 | 3.2473 | 0.3079 |
| ts_c4 | 3059.3 | 3.2687 | 0.3059 |
| ts_c5 | 3692.9 | 2.7079 | 0.3693 |
| her_status0 | 10000.0 | 1.0000 | 1.0000 |
Procedura PHREG
Analiza bayesowska